念のためインストール権限とプロファイルに対するアクセス権限などを確認してみて
ください。
（UAC の設定や管理者権限ユーザアカウントの詳細など）　
＊単純な再インストールはほとんどの場合、意味がありません。
　
また以下のトラブルシューティングなどを参考にして新規プロファイルを追加作成し
てそれを適用して改善されるか試してみてください。
[参考]
[url=http://mozilla.jp/thunderbird/3.1.10/releasenotes/#troubleshooting]Mozilla Thunderbird 3.1.10 リリースノート - トラブルシューティング[/url]
[url=http://support.mozillamessaging.com/ja/kb/profiles]プロファイル | 操作方法 | Thunderbird ヘルプ[/url]
[url=http://support.mozillamessaging.com/ja/kb/using-multiple-profiles]複数のプロファイルを使用する | 操作方法 | Thunderbird ヘルプ[/url]
　

初めての質問です。

私も同じメールを何度も受信してしまうという症状に悩まされており、こちらのフォーラムで
・ Inbox.msfの破損
・popstate.datの破損
が原因ではないかと思い当たりました。

しかし、上層フォルダの読み取り専用属性を変更できず、解決に至りません。

プロパティ→読み取り専用のチェックBOXを無効化

しているのですが、再度開くと読み取り専用にチェックが入った状態に戻ってしまいます。
（何度かアンインストールとインストールを繰り返したのですが、同じでした。）

直接ソフトに関係がないのかも知れませんが、解決方法をご教授いただけるとありがたいです。

ちなみに環境は
windows7 32bit
Tunderbird 3.1.10
です。

よろしくお願いいたします。