解答ありがとうございました。
AVGの無料版を使用しており、ログを調べましたが2日前のものはすでに見れなくなっておりました。

検疫を見てもそれらしいものはなく、どこへいったか不思議でなりません。

解答ありがとうございます。
アカウントはPOPです。Mailフォルダー内確認しましたが、全く見当たらず、
データ復旧ソフトも多数試しましたが、.msfとのペアで近々削除されたものは全く見つかりませんでした....

しばらくドライブ内をいじった記憶もないので不思議で仕方がありません....

突然消えたということを考えると、セキュリティソフトが脅威を検知して「保存済み」を削除か隔離した可能性もあるかと。
削除なら元には戻りませんが、隔離であれば元に戻せるかもしれません。
セキュリティソフトのログを調べてみてはいかがでしょう。

AKBrown さん、EarlgreyTea と申します。

[quote="AKBrown"]昨日夜頃よりこれまでThunderbirdで「保存済み」名のフォルダを作り保管していたメールがフォルダーごとみえなくなりました。

全てのフォルダー表示になっており、[/quote]
ここまでは Thunderbird の画面上のことですね。

[quote="AKBrown"]Profilesフォルダーも一通り見てみましたが発見できません...[/quote]
こちらはプロファイルに保存されたファイルを探されたのですね。
それでしたら「Profiles」フォルダー全体を見る必要はなく、使用しているプロファイルだけでいいと思います。
（Thunderbird の画面操作から別プロファイルへどうこうはできないはず）

使用しているプロファイルは、ヘルプ＞トラブルシューティング情報を開き、「アプリケーション基本情報」の「プロファイルフォルダー」の項目の「フォルダーを開く」でアクセスできます。

アカウントはPOPとIMAPのどちらでしょうか。
メッセージの保存先のフォルダーは、POPなら「Mail」フォルダー内、IMAPなら「ImapMail」フォルダー内に、受信サーバーの名前のフォルダーとしてできているはずです。

POPであれば「保存済み」という名前の拡張子無しファイルと拡張子が「.msf」のファイルのペアで保存されているはずです。
IMAPだった場合、サーバーによってはフォルダー名が「修正UTF-7」というものでエンコードした名前になっていることがあります。

昨日夜頃よりこれまでThunderbirdで「保存済み」名のフォルダを作り保管していたメールがフォルダーごとみえなくなりました。

全てのフォルダー表示になっており、Profilesフォルダーも一通り見てみましたが発見できません...
大切なものもあるのでできれば復元したいのですが....

よろしくお願いします。