kowappa さん、EarlgreyTea と申します。

[quote="kowappa"]サンダーバードに登録したyahooメールの元のアカウントから、受信したメールが消えてしまいました。[/quote]
「元のアカウント」が何を指しているのかがわかりません。
もしかして、Yahoo!メールのサーバー上のメールが削除されたということでしょうか。

ThunderbirdでIMAPアカウントを設定したのであれば、サーバーと同期していますのでThunderbirdで削除すればサーバーのメールも削除されます。
POPアカウントを設定したのであれば、POPは元々メールを受信したらサーバーから削除する作法でした。
それをさせないためには「ダウンロード後もサーバーにメッセージを残す」にチェックが入っていることを確認しましょう。
そして必要に応じ、「ダウンロードしてから [　　] 日以上経過したメッセージは削除する」や「ダウンロードしたメッセージを削除したらサーバーからも削除する」のチェックを外しましょう。

サンダーバードに登録したyahooメールの元のアカウントから、受信したメールが消えてしまいました。
これはどうすれば直せるでしょうか。