調べてくださり、ありがとうございます。
お手数おかけしました。

[quote="Tomkeifer"]バージョン128.2.3esrでタイトルバーがWindowsで設定した色を反映しなくなりました。[/quote]
仕様ですね。

Bug 1916089 Remove the AccentColor background on the titlebar

正確には 128.2.2esr で変更が入りました。
かなり遅くなりましたが、Firefox に合わせての変更です。

【追記】
Firefox の方は Ver.89 の Proton UI 採用時です。

バージョン128.2.3esrでタイトルバーがWindowsで設定した色を反映しなくなりました。

■再現手順
１．Windows11の設定 > 個人用設定 > 色
２．規定のWindowsモードを選択してください　→ 「ダーク」
３．Windowsの色を適当な色を選択する
４．タイトルバーとウィンドウの境界線にアクセント カラーを表示する → 「オン」

以前のThunderbirdでは上記で選択した色がタスクバーに反映されていました。