グランディム さん、EarlgreyTea と申します。

状況を一行で書かれましてもあまりにも情報が不足しすぎです。
そして状況がわからなければ有効なアドバイスもできません。

問1：Thunderbirdのバージョンを教えてください。

問2：問題のアカウントの種類はPOP／IMAPどちらでしょうか。IMAPの場合は（可能ならば）どちらのメールサービスをご利用か教えてください。

問3：「受信トレイのメールを削除しても、勝手に復活」とのことですがそういう話は初耳です。下記のような観点で状況を詳細に教えてください。
[list]
[*]メールを削除する操作を行った際に受信トレイから消えてごみ箱に移動されたのか。
[*]どういう操作を行った時点でメールが復活しているのか。[/list]

受信トレイのメールを削除しても、勝手に復活してしまいます。回避する方法をご教示ください。