表示されるようになりました。

設定 → 一般 → ハードウェアアクセラレーション機能を使用する
のハードウェアアクセラレーション機能をOFFにして再起動したら
ボタン表示されました。

が、ボタン部分（領域）は、テーマカラーではなくデフォルトテーマカラーで表示されてます。

私もテーマをデフォルトから変更すると
最小化、最大化・元に戻す・閉じる　ボタンが表示されません。
Windows 8.1です。
Windows 10なら大丈夫なのですね。
スクリーンショットアップは、どうすれば良いのでしょうか？

stock さん、EarlgreyTea と申します。

[quote="stock"]閉じるボタンや最少表示ボタンなどが正しく表示されない。

設定/アドオンとテーマ/テーマ/dark[/quote]
Thunderbird のバージョンが書かれていませんが、Ver.115をお使いでしょうか。
OS は Windows 7ですね。
さすがに Windows 7の表示がどんなだったか忘れてしまいましたので、スクリーンショットの画像を見せていただけないでしょうか。
Aeroテーマとか色々違うはずです。

当方のWindows 10環境でDarkテーマ適用した場合はこうなります。[attachment=0]ダークテーマ(Win10・TB115).jpg[/attachment]

閉じるボタンや最少表示ボタンなどが正しく表示されない。

設定/アドオンとテーマ/テーマ/dark

背景を黒に設定すると、閉じるボタンが見えなくなりました。
その位置でクリックすると機能はしています。