Mountain rat さん、事例報告ありがとうございます。

ところで2点質問があります。

• ブラウザーでのYahoo! JAPANログイン状態と、Windows 10で再起動したことと、どちらが解決に寄与したとお考えでしょうか。
• 後半の文体が変わっていますが、もしかしてどちらかからの引用でしょうか。

［windows10　Home　Thunderbird68.7.0(32bit)］

参考になるか判りませんが、発生の状況と解消の経緯を以下に記載します。
《発生の経緯》
yahooのアカウントを削除後にThunderbirdを再起動し
再度yahooアカウント設定するもログインできませんでした。

メールサーバ pop.mail.yahoo.co.jp からの応答で
［Incorrect username or password.]と表示されます。

yahooメール設定で、
・IMAP/POP/SMTPアクセスとメール転送は選択済
・IMAP/POP/SMTPは全て有効
・自動転送は無効
は確認済です。

yahoo　Japan　はログイン状態で以前は受信できました。

《問題解消の手順》
1）Windows10の再起動（シャットダウンではありません）
2）yahoo　Japanが[ログインしたままにする]となっていたので
　　yahooメールからログアウトしてYahooを終了。
3）再度yahoo　Jaｐanｗに[ログインしたままにする]の
　　チェックを外してログイン　＆　ログアウト
4）Thunderbirdを起動でYahooメールの受信に成功

※Windows10の「シャットダウン」と「再起動」はWindowsの終了時に
PCへ保存されるデータが異なり、その後に起動するときの動作に違いが出るからだ。

シャットダウンでは「高速スタートアップ」機能が有効のまま電源がオフになる。
シャットダウン後に素早く起動するためのPCのシステム情報をファイルに保存する為、
保存されたデータが起動時に読み込まれ、問題が起きる場合がある。

その為トラブルが発生した場合には高速スタートアップを利用しない「再起動」が推奨となる。