自分のPC(Windows8.1&Thunderbird52.4.0)で試してみた結果だけお知らせします。
受信トレイに未読メールがあっても、新規に受信した場合でも音は鳴りました。
別PC(Ubuntu16.04.3&Thunderbird52.4.0(Canonical提供版))では、未読メールが在る場合は、新規に受信した場合、音は鳴りませんでした。
tosri さんが書きました:
(時々音が鳴る時があります。)
と、ありますが、どういう時に未読があっても音が鳴るのか詳細な状況を掴まないと原因はわからないのでは?
自分のPC(Ubuntu)でThunderbirdを起動させて、未読を残したまま、数時間様子を見てましたが、時々音が鳴るような状況はありませんでした。
それから、バグみたいな事を書かれてますが、Bugzillaに載っていたのですか?
また
tosriさんがお使いのThunderbirdはMozillaオリジナルですか?それともCanonical提供版ですか。