meeyarさんありがとうございます。
教えていただいた方法を試してみます。
また、報告させていただきます。

[color=#0000ff]まずは使用環境をお書きください[/color](OSの種類や、使用しているアドオンがあればその名前など)。
それから、先だってThunderbirdの38.7.0が出ていますので更新を勧めます。
[url=http://mozillazine.jp/?p=5078]MozillaZine.jp » Blog Archive » Thunderbird 38.7.0 がリリースされた[/url]

[quote="happy"]Ｔｈｕｎｄｅｒｂｉｒｄ38.6.0を使っています。ローカルフォルダーの内容をフィルターを使って削除していますが内容は消えているのに件名だけ表示されたままになる場合があります。内容があると思って件名を選択すると、何も表示されません。[/quote]
件名の表示と、実際に存在する(はず)のメール本体との整合性が取れていないのですね。

現時点で原因がはっきりしていないので、まずは何かをする[b]前に[/b]プロファイルのバックアップを取ることをお勧めします。
プロファイルの場所は以下参照
[url=https://support.mozilla.org/ja/kb/profiles-thunderbird]Thunderbird のプロファイル | Thunderbird ヘルプ[/url]

メール本体のデータが健全or残っていれば、フォルダの最適化で直るかもしれません。
以下を参考の上、問題が出るフォルダについて最適化を行ってみてください。
[url=https://support.mozilla.org/ja/kb/compacting-folders]フォルダの最適化 | Thunderbird ヘルプ[/url]

これで駄目な場合は、プロファイル自体が壊れている可能性もあります。

Ｔｈｕｎｄｅｒｂｉｒｄ38.6.0を使っています。ローカルフォルダーの内容をフィルターを使って削除していますが内容は消えているのに件名だけ表示されたままになる場合があります。内容があると思って件名を選択すると、何も表示されません。原因をご存知の方おられましたら。教えていただけますと助かります。よろしくお願いします。