Thunderbirdを使い始めた当初、同じ現象で困りました。

フォルダツリーはなくなったわけでなく、左端に隠れているだけと思います。

画面の左端の枠の部分をマウスでつまんで（クリックしたままにして）、右に引っ張ってみてください。

ご参考。

受信トレイの中身が突然消えました！！
http://mozillazine.jp/forums/viewtopic.php?t=1813

突然データがなくなりました。
http://mozillazine.jp/forums/viewtopic.php?t=2129

受信トレイの中にあるフォルダが消える！
http://mozillazine.jp/forums/viewtopic.php?t=2107

PCど素人です。
何かの拍子に、画面左の欄（ローカルフォルダ、受信フォルダ、送信フォルダ、ゴミ箱など)が消えてしまい、「受信フォルダ｣の中身しか出なくなってしまいました。
（アプリケーションを開くと「ローカルフォルダ｣ではなく、いきなり｢受信フォルダ｣になってしまう。)
何をどうすれば元のレイアウトになるのかさっぱりわかりません。
今まで送ったメールを見ることもできなくて困っています。
FAQやこちらのトピック、さらには市販されている本まで見てみましたが、さっぱりわかりません。
どなたかわかりやすくに説明していただけませんでしょうか。
WinXp、VAIO PCG-R505Qを使用しています。
よろしくお願いします。