Thunderbirdの38.6.0がリリースされました。
[url=https://www.mozilla.org/en-US/thunderbird/38.6.0/releasenotes/]Thunderbird — Notes (38.6.0) — Mozilla[/url]

これに伴い、Mozilla Maintenance Serviceが入った環境においても、38.6.0にアップデート後は38.6.0の情報のみが残り、38.5.0の表記は消えています。（[url=http://torikagotonari.hatenablog.com/entry/2016/02/16/220451]ブログ[/url]の画像を縮小）[attachment=0]tb38-6l.jpg[/attachment]
そういうことですので、[quote="岸部露伴"]今後、この状態のままもっと新しいバージョン(たとえば38.5.2とか38.6とか)が公開された場合、
38.5.0から問題なくアップデートできるのでしょうか？[/quote]
に関しては、「特に問題ない」というのを確認しました。
また、今後類似した状況が発生した場合も、同じような対処で出来るのでは…という印象です。
またJVN絡みの問題については、[url=http://jvndb.jvn.jp/apis/myjvn/faq.html#vc-q022]MyJVN - よくある質問と答え（FAQ）[/url]も参照してください。

私もWindows7（64bit）でThunderbirdを使っています。
しばらく前に38.5.0から38.5.1へのアップデートを[ヘルプ]-[Thunderbirdについて]より実施しましたが、
その後、MyJVN バージョンチェッカでThunderbirdのバージョンが古いと認識されるようになり、
不思議に思っていました。
岸部露伴さんの投稿により原因が判明したので、
Thunderbirdをアンインストールして、再度インストールすることにより、
MyJVN バージョンチェッカで正しく判定されるようになりました。
ありがとうございました。

バグかどうかはわかりませんが、修正されると嬉しいですね。

この件について少し調べました。
Thunderbirdそのものというよりは、Mozilla Maintenance Service側の不具合に思います。
Mozilla Maintenance serviceの解説：
https://support.mozilla.org/ja/kb/what-mozilla-maintenance-service

【検証内容】
Windows8.1環境下です。
[list=1]
[*]Mozilla Maintenance Serviceをアンインストールしておく[attachment=1]mms.png[/attachment]
[*]Thunderbird38.5.1と38.5.0の両方を一度アンインストールする
[*]Thunderbird38.5.0をインストールし直す
この時に、「標準インストール」ではなく「カスタムインストール」を選びます。
[*]Mozilla Maintenance Serviceをインストールするか聞かれるので、「Maintenanceサービスをインストールする」のチェックを外す[attachment=0]mms2.png[/attachment]
[*]そのままインストールする[/list]
この状態でThunderbirdを起動すると38.5.0なので、メニューの「ヘルプ(H)」→「Thunderbirdについて」でアップデートがかかるのですが、38.5.1にした後でも38.5.0の表示が残りません。

Bugzillaでの報告は
Bug 1237858 :Installing older version Maintenance Service makes control panel information display the older version again
が近いように思いますが自信ありません。

　
[color=#006600]＊質問・投稿する前に、製品のヘルプ、このフォーラム内を検索・閲覧して該当項目や
　同類・類似事例がないか、確認してみましょう。
　また、広くインターネット上でも同類・類似事例がないか、調べてみましょう。
＊質問・投稿する前に [url=http://forums.mozillazine.jp/faq.php?mode=forum]フォーラムの利用について[/url] をしっかり読んで、その内容を理解
　した上で、それに沿って投稿しましょう。
＊ここは相互ユーザサポートを通じて、各種情報・事例をユーザ同士でシェアする場で
　もあります。[/color]
　
　
[quote="岸部露伴"]これは製品のバグなのでしょうか？[/quote]
バグかも知れませんし、バグではないかも知れません。
尚、バグについては [url=https://bugzilla.mozilla.org/]Bugzilla[/url] にて扱います。

当方でも過去に二つの異なるバージョンが、コントロールパネルの「プログラムと機能」に
存在したことがありましたが、岸部露伴 さんと同じ手順で正常にしました。
おそらくインストールやアンインストールのレジストリ情報の書き換えが正常にできなかっ
たものと思われます。

正常に機能しているのであれば、それほど気にすることはないと思いますが・・・。
気がついたときにでも修正してやればいいかと。

[quote="岸部露伴"]この状態は新旧どちらのバージョンで動作しているのでしょうか？[/quote]
meeyar さんが書かれているように、メニューのヘルプから確認できます。
[参照]
[url=https://support.mozilla.org/ja/kb/build-number-not-displayed#thunderbird]ビルド番号が表示されない | Thunderbird ヘルプ[/url]

[quote="岸部露伴"]この状態でThunderbirdを使用し続けても問題ないのでしょうか？[/quote]
正常に動作しているのならば問題ないかと思われます。

[quote="岸部露伴"]この状態に陥らないよう、38.5.0から38.5.1 へアップデートする方法はあるのでしょうか？[/quote]
岸部露伴 さんがおこなった手順でアップデートできます。

[quote="岸部露伴"]今後、この状態のままもっと新しいバージョン(たとえば38.5.2とか38.6とか)が公開された場合、
38.5.0から問題なくアップデートできるのでしょうか？[/quote]
おそらく問題ないかと思われますが、実際にはそのときになってみないとわかりません。
もし今回と同じ問題が起きたら、岸部露伴 さんがおこなった同様の手順でいいでしょう。

[quote="岸部露伴"]本件のようなことが発生すると都度、
多数の問い合わせを受ける立場ですので、
その視点でいえば勘弁してほしいトラブルになります・・・[/quote]
法人利用の場合は、その対象が多くなるのでお気持ちもわかります。
一方で管理上のコストは必要なものですので、一元管理や法人サポートの導入を検討される
のをお勧めします。

[参照]
[url=http://www.mozilla.jp/business/support/]Firefox と Thunderbird の法人向けサポート | 法人向け情報 | Mozilla Japan[/url]
[url=http://www.mozilla.jp/business/faq/]Firefox と Thunderbird のよくある質問 | 法人向け情報 | Mozilla Japan[/url]
[url=http://www.mozilla.jp/business/faq/tech/]技術的なよくある質問 | Mozilla Japan[/url]

meeyar さん、ご返信ありがとうございます。

大変参考になりました。

＞＞バグと言われればバグかもですが…
＞＞特段問題出ていないあたり「直すべき」のものであるかと言われると。

職場で300台ほど Windows 7 Pro の個人用PCがあって、
各自がMyJVN バージョンチェッカ　でSWの更新有無を確認し、
更新を実施してます。

http://jvndb.jvn.jp/apis/myjvn/vccheck.html

本件のようなことが発生すると都度、
多数の問い合わせを受ける立場ですので、
その視点でいえば勘弁してほしいトラブルになります・・・
単なる愚痴になってしまいますが。

[quote="岸部露伴"]環境：Windows 7 Professional(32bit),Windows 7 Starter
にて以下の事象を確認しました。

38.5.0から38.5.1へのアップデートを[ヘルプ]-[Thunderbirdについて]より実施すると、
Windowsの[プログラムのアンインストールまたは変更]にて両方のバージョンがインストールされている状態になります[/quote]
[quote="岸部露伴"]これは製品のバグなのでしょうか？
この状態は新旧どちらのバージョンで動作しているのでしょうか？
この状態でThunderbirdを使用し続けても問題ないのでしょうか？[/quote]
「Windowsの[プログラムのアンインストールまたは変更]」というのは、コントロールパネル内の「プログラムと機能」内のものですね。

バグと言われればバグかもですが…
特段問題出ていないあたり「直すべき」のものであるかと言われると。

こちらの環境(Win8.1+Thunderbird38.5.1)でも確認してみました。
確かに「プログラムのアンインストールまたは変更」の中には38.5.0と38.5.1の両方がありますが、肝心のインストールフォルダ(規定ではC:\Program Files (x86)\Mozilla Thunderbird)内のThunderbird.exeは1つのみで、バージョンは38.5.1ですね。(添付画像参照)[attachment=0]tbexe2.png[/attachment]
起動中のThunderbirdのバージョンについては、
アプリメニュー(三)の「ヘルプ」→Thunderbirdについて
メニューバーのヘルプ(H)→Thunderbirdについて(A)
で確認できます。
こちらも38.5.1ですね。
特に問題もなく使えています。

[list]
[*]アップデートは問題なく38.5.0→38.5.1で更新されている(なので、起動した時のバージョンは38.5.1になる)
[*]アンインストールの情報が中途半端に残っている[/list]という感じでしょうか。
そこまで詳しく調べたわけではなく、あくまで印象ですが。

[quote="岸部露伴"]この状態に陥らないよう、38.5.0から38.5.1 へアップデートする方法はあるのでしょうか？[/quote]については存じませんが、
[quote="岸部露伴"]今後、この状態のままもっと新しいバージョン(たとえば38.5.2とか38.6とか)が公開された場合、
38.5.0から問題なくアップデートできるのでしょうか？[/quote]
これは特に問題ないと思います。
以前(38.2くらいの頃)も似たようなケースがあったように思いますが、特段問題なくアップデートしてました。

環境：Windows 7 Professional(32bit),Windows 7 Starter
にて以下の事象を確認しました。

38.5.0から38.5.1へのアップデートを[ヘルプ]-[Thunderbirdについて]より実施すると、
Windowsの[プログラムのアンインストールまたは変更]にて両方のバージョンがインストールされている状態になります。
この状態になってもThunderbird はメール送受信等、ふだん使用する機能に影響は見当たりません。
また、両製品をいったんアンインストールした後に38.5.1をインストールすることで回復します。

疑問に思っている点を列挙します。

これは製品のバグなのでしょうか？
この状態は新旧どちらのバージョンで動作しているのでしょうか？
この状態でThunderbirdを使用し続けても問題ないのでしょうか？
この状態に陥らないよう、38.5.0から38.5.1 へアップデートする方法はあるのでしょうか？
今後、この状態のままもっと新しいバージョン(たとえば38.5.2とか38.6とか)が公開された場合、
38.5.0から問題なくアップデートできるのでしょうか？