まずは使用環境(OSの種類やThunderbirdのバージョン、アドオンの名前など)をお書きください。
MozillaZine.jp フォーラム ・ トピック - フォーラムの利用について [投稿する前にお読みください]本題です。
クイックフィルタバーの「未読」にチェックが入っていませんか?
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これではない場合、Thunderbirdの定石的なトラブルシューティングを試してみてください。
・セーフモードを試す(アドオンの干渉の有無)
Thunderbird のセーフモード | Thunderbird ヘルプ・新規プロファイルの作成、適用
複数のプロファイルを使用する | Thunderbird ヘルプ