早々のご回答ありがとうございました。
時間ができ次第、試してみたいと思います。
新しく届くメールは問題がないので、今は何とかなっておりますが、
過去メールの中にも重要なものがありますので、
近日中に試そうと思います。

ご丁寧にご教示いただき、ありがとうございました。

　　
[color=#006600]＊質問・投稿する前に、サポートサイトやヘルプ、このフォーラム内を検索・閲覧して
　確認してみましょう。
＊質問・投稿する前に [url=http://forums.mozillazine.jp/faq.php?mode=forum]フォーラムの利用について[/url] をしっかり読んで、その内容を理解
　した上で、それに沿って投稿しましょう。
＊ご自分の利用環境として、正確な OS の種類と Thunderbird のバージョンぐらいは
　書き添えましょう。
＊質問した後やアドバイスをもらった後は、放置せずに、結果や経緯を必ず書くように
　しましょう。[/color]　
　
　
問題の内容から推察すると、
１．Thunderbird のアップデートが正常にできていない
２．「受信トレイ」の要約（インデックス）ファイルの不整合か、破損
３．Thunderbird のプロファイル内にあるメッセージデータの破損
が考えられます。


上記の対処方法は以下になります。
改善されるかどうか、順番に試してみましょう。
そして、その結果を教えてください。

１．一旦 Thunderbird をアンインストールして、再インストール
　　　[color=#006600]＃プロファイル（メッセージを含む各種ユーザデータ）は、削除されません。[/color]

２．以下の三つの方法です。
　　[b][メッセージのインデックスファイルの不整合修正方法][/b]
　　以下の順番でおこない、その都度改善されたか確認してみましょう。
　　
　　【最適化】
　　「受信トレイ」に対して「最適化」をおこなう。
　　　[color=#006600]＃「最適化」はメニューにあります。
　　　　[ファイル] > [フォルダを最適化] または該当フォルダを選択して、右クリ
　　　　ックして、開いたメニューから [最適化] の実行です。[/color]
　　【フォルダを修復】
　　最適化をおこなっても改善されない場合は「フォルダを修復」をおこなう。
　　　[color=#006600]＃該当フォルダを右クリックして、開いたメニューから「プロパティ」を開き、
　　　　[一般情報] タブ内の下段にあります。[/color]
　　【インデックスファイルの初期化】
　　プロファイルフォルダ内の該当フォルダのインデックスファイル（*.msf）を削除、
　　またはリネーム、あるいは移動します。
　　　[color=#006600]＃Thunderbird を終了させた状態でおこない、次期起動時に自動的に再生成され
　　　　ます。（初期化）[/color]

　　【お勧め】
　　「最適化」を、半自動的に、実行できるようにしておきましょう。
　　メッセージの削除などをおこなった際に、「最適化」の実行を促すウィンドウが、
　　自動的に表示されるようになります。
　　[ツール] > [オプション] > [詳細] > [ネットワークとディスク領域] > [ディスク　
　　領域] で「ディスク領域を　　MB 以上節約できるときはフォルダを最適化する」に
　　チェックを入れて、有効にして、任意のサイズ設定をしておきましょう。

３．Thunderbird の新規プロファイルを、「追加」作成し、それを適用します。
　　[参照]
　　[url=http://support.mozillamessaging.com/ja/kb/using-multiple-profiles]複数のプロファイルを使用する | 操作方法 | Thunderbird ヘルプ[/url]


【補足】
原因は不明ですが、同じプロファイルを、異なるバージョンで使いまわしていると
起こりやすいです。
上記の２の場合は、「受信トレイ」に大量のメッセージを溜め込んでいたり、最適
化をほとんどしていない状況で、起こりやすいと思われます。
アップデート以前から、何かしらの問題があって、それがアップデート後に表面化
することも考えられます。
また、OS や HDD の状態が不安定なことも可能性に含まれるでしょう。

2013年2月21日にthunderbirdの更新が行われたが、その後、過去の受診トレイ内のメールがすべて読めなくなった。件名と差出人はそのまま残っているが、メールを開くと完全に空白になっているもの、他のメール情報がまじったものなど、内容がぐちゃぐちゃになってしまいました。元のメールに戻すことは可能なのでしょうか。