バージョン 17.0 + Windows XP でクラシックテーマを適用していると起こる問題の
ようです。
ウィンドウのタイトルバーとメニューバーの背景色が、同一になる問題です。
他の箇所も同一になる場合があるようです。
Windows 7 のクラシックテーマでも再現する報告があるようですが、当方では未確認
です。

以下にバグとしてファイルされて、バージョン 17.0.2 で修正されました。
[url=https://bugzilla.mozilla.org/show_bug.cgi?id=813638]Bug 813638 – Under Windows Classic Theme Thunderbird 17 title bar is same colour as window background[/url]


わかりやすいスクリーンショットは、以下に紹介されていました。
[url=https://getsatisfaction.com/mozilla_messaging/topics/thunderbird_17_0_horrible_bright_blue_menu_bar]Thunderbird 17.0 on Win XP - Horrible bright blue menu bar.[/url]
[url=http://forums.mozfr.org/viewtopic.php?f=4&t=109356#p711696]Geckozone • Consulter le sujet - [Résolu] TB 17 : horrible thème par défaut sous Win XP ?[/url]

　　
[color=#006600]＊質問・投稿する前に、サポートサイトやヘルプ、このフォーラム内を検索・閲覧して
　確認してみましょう。
＊質問・投稿する前に [url=http://forums.mozillazine.jp/faq.php?mode=forum]フォーラムの利用について[/url] をしっかり読んで、その内容を理解
　した上で、それに沿って投稿しましょう。
＊質問した後やアドバイスをもらった後は、放置せずに、結果や経緯を必ず書くように
　しましょう。[/color]　
　
　
[quote="godensen"]いつの間にかメニューの部分がフォルダー含め全てブルーになってしまいました。[/quote]
具体的にわからないので、スクリーンショットを、ここに貼り付けてください。

[補足]
このフォーラムでは、画像（スクリーンショット）の貼り付けは、以下の仕様になっていま
す。
また、このフォーラムでの画像（スクリーンショット）のアップロードは、登録ユーザでな
いと利用できない仕様です。
[img] タグを用いた方法ならば、ゲストユーザでも貼り付ける（リンク表示）ことは可能で
す。参照してみてください。
[url=http://forums.mozillazine.jp/faq.php?mode=bbcode#f5r0]MozillaZine.jp フォーラム • BBCode ガイド - 画像の表示[/url]


以下の過去トピックを、しっかり読んで、実際に試して、検証して、確かめてください。
そして、その結果を、ここに追記してください。

[参照]
[url=http://forums.mozillazine.jp/viewtopic.php?f=3&t=13699]メニューバー等の表示違いについて[/url]

いつの間にかメニューの部分がフォルダー含め全てブルーになってしまいました。

使用環境は
OS:Windows XP
Thunderbird のバージョン:17.0
メールプロバイダ:ISP:so-net
ウイルス対策:ESET Smart Security 5.2.11.3
です。

どなたかご教授下さい。