アカウントを削除しただけなら、メッセージデータはおそらく残っているでしょう。

元に戻すのは以下の過去トピックを参照してください。
削除したアカウントを復活したい
　

こんばんは。
一旦POPで受信設定していたアカウントを消した場合、Thunderbirdにはまだメールが残っている
かどうか教えて頂けないでしょうか。

OSはWindows Vistaで、Thunderbirdは10.0.2です。
メールは主にYahooを利用しています。

幾つかのメールアカウントをThunderbirdでまとめて見ようと思いアカウントの登録をしていました。
IMAPで受信してメールサーバのメールは消さない予定でしたが、Yahooメールの設定をPOP受信に
してしまったようで、かつThunderbirdの登録アカウントを整理しているうちに、誤ってそのアカウント
を削除してしまったようなのです。（後日気づきました）

当然のことながらYahooのサーバーには何もメールは残っていません。

Thunderbirdの方に残っていれば復元させていのでお知恵を貸してください。
よろしくお願いします。