確認結果を了解しました。

オプション設定が反映されない、セーフモード起動でも再現するとなるとプロファイルの
一部が壊れているか、Thunderbird 本体が正常に動作していない可能性が考えられます。

以下のトラブルシューティングをおこなって対処してください。
[color=#006600]　＃新規プロファイルの追加作成とその適用、再インストールなどです。[/color]
[url=http://mozilla.jp/thunderbird/7.0.1/releasenotes/#sec-troubleshooting]Mozilla Thunderbird 7.0.1 リリースノート - トラブルシューティング[/url]
[url=http://support.mozillamessaging.com/ja/kb/using-multiple-profiles]複数のプロファイルを使用する | 操作方法 | Thunderbird ヘルプ[/url]
　

【補足】
[quote="R7038XX"]現象のわかりやすいメールは、
Facebookからの通知メールが、背景白に、白文字で表示されます.[/quote]
誰もがそのメールを受け取っているわけではありませんし、見ているわけでもありません
し、メールのソースを確認できるわけではないので「わかりやすい」とはなりません。
かえって具体性が欠けていて「わかりにくい」です。
　

初心者で情報が不足してしまい、申し訳ございません.

環境は
Windows7
Thunderbird7.0.1
です.

現象のわかりやすいメールは、
Facebookからの通知メールが、背景白に、白文字で表示されます.

１．メニューの [表示] > [メッセージの表示形式] はどのようになっていますか？

オリジナルHTMLとなっています

２．[オプション] > [表示] > [配色] > 「文字色」「背景色」はどうなっていますか？

白と黒が指定されています

３．何かテーマを入れていますか？あるいは拡張機能は入れていますか？

テーマは入れていません
拡張機能は
CompactHeader
ConfigDate
EmojiPrint
Manually sort folders
MinimizeToTray revived (MinTrayR)
です

４．Thunderbird のセーフモード起動でも再現しますか？　

変わりません

　
[color=#006600]＊質問・投稿する前に [url=http://forums.mozillazine.jp/faq.php?mode=forum]フォーラムの利用について[/url] を読んでその内容を理解した上でそれに
　沿って投稿しましょう。
＊ご自分の利用環境として OS の種類ぐらいは書き添えましょう。
＊質問した後やアドバイスをもらった後には結果や経緯を必ず書くようにしましょう。[/color]


すべての HTML 形式メッセージが同様の状態で表示されるのですね。
以下を確認して教えてください。

１．メニューの [表示] > [メッセージの表示形式] はどのようになっていますか？
２．[オプション] > [表示] > [配色] > 「文字色」「背景色」はどうなっていますか？
３．何かテーマを入れていますか？あるいは拡張機能は入れていますか？
４．Thunderbird のセーフモード起動でも再現しますか？　
　

一応確認しますが、テーマを適応してたら、テーマの配色が鑑賞してる可能性も否定は出来無いと思います。

オプションの表示～配色
文字色と背景色は各々適宜設定されてますか？

リッチテキスト全般で起きますが、
カラフルにデザインされたものだと、起きていないようです
背景と文字の色が指定されている場合はOKな感じです

リッチテキストです。

Thunderbird 7.0.1

受信メールの表示形態が「リッチテキスト」なのでしょうか？
テキスト形式での表示でも再現するのか？

又、特定のメールのみが再現するのか？
リッチテキストで送信された着信メール全般で再現するのか？
更に、自分で作成したHTMLメールでも再現するのか？

等々情報が不足してます。

HTMLメールの背景が黒となり、文字も黒色なので、文字が潰れてしまい読み取れません
何が原因と考えられるのでしょうか？