このフォーラムで障害のあった時期をはさんで時間が経過していますから、もうご覧になっておられないかもしれませんが......。

ご質問の文面から推測する限りでは、Thunderbird の基本的な動作に問題があるように見受けられます。

まったく新規に Thunderbird 5.0 をインストールした当初から起こっている現象でしょうか。
以前のバージョンの Thunderbird では問題なく、5.0 にアップグレードしたら起こり出した現象でしょうか。

OS 的には、Thunderbird 5.0 のシステム要件を満たしていますが、ハードウェア的にはいかがでしょう。
念のため下記と比較してみてください。
http://mozilla.jp/thunderbird/5.0/system-requirements/

もしもハードウェア的に厳しいと、Thunderbird は起動するものの、複数のウィンドウ（メイン、メッセージ作成、アドレス帳など）を開いたり、並列作業をおこなったり、システムに負荷がかかる作業になると動作に支障が出てくることがあるのかもしれません。

システム要件に関してはまったく問題ない場合は、インストールや更新に失敗しているか、プロファイルにダメージを受けている可能性が考えられます。
一度、セーフモードや新規プロファイで Thunderbird の動作を確かめてみると、問題点が絞り込めるかもしれません。
最終的にはクリーンインストールでしょうか。
（参考）
・[url=http://support.mozillamessaging.com/ja/kb/safe-mode]セーフモード[/url]
・[url=http://support.mozillamessaging.com/ja/kb/profiles]プロファイル[/url]
・[url=http://support.mozillamessaging.com/ja/kb/using-multiple-profiles]複数のプロファイルを使用する[/url]

とりあえず以上です。外してたらすみません。

Thunderbird5.0を I MAC(OS10.6.7)で利用していますが、メールの返信時や新規作成時にウィンドウが開きません。

上部バーのウィンドウを見ると、受信トレイの下に新規作成や返信メールの項目は作成されています。

ちなみに、受信トレイ（メイン画面）のウィンドウを閉じて、新規作成すると新規メールのウィンドウが開きます。

分かる方、教えてください。