[color=#006600]＊質問・投稿する前に [url=http://forums.mozillazine.jp/faq.php?mode=forum]フォーラムの利用について[/url] を読むのをお勧めします。
＊環境として OS の種類、Thunderbird のバージョンぐらいは書き添えましょう。
＊質問した後やアドバイスをもらった後には結果や経緯を必ず書くようにしましょう。[/color]
　

[quote="snow"]すべてインポートされたようですので、
整理しようと、フォルダの「名前を変更」でクリックしたのに、
元々のフォルダ名は残って、
それとは別に新たにフォルダができました。[/quote]
何から何をインポートされたのですか？
インポート後にできたフォルダ名は？
フォルダの「名前を変更」で新たにできたフォルダ名は？

[quote="snow"]不要な方は消せばいいだけかと思ったのですが、
元のフォルダにも、新しいフォルダにも
中にあったメールが１つもありません。[/quote]
インポート後に一旦 Thunderbird を再起動させましたか？

とりあえず以下を参照して Thunderbird のセーフモード起動や新規プロファイルでも再現するか
試して確認してみましょう。（念のため Thunderbird の再インストールも）
[url=http://mozilla.jp/thunderbird/3.1.9/releasenotes/#troubleshooting]Mozilla Thunderbird 3.1.9 リリースノート - トラブルシューティング[/url]
[url=https://support.mozillamessaging.com/ja/kb/%E3%82%BB%E3%83%BC%E3%83%95%E3%83%A2%E3%83%BC%E3%83%89]Mozilla Messaging / ナレッジベース / セーフモード[/url]
[url=https://support.mozillamessaging.com/ja/kb/%E8%A4%87%E6%95%B0%E3%81%AE%E3%83%97%E3%83%AD%E3%83%95%E3%82%A1%E3%82%A4%E3%83%AB%E3%82%92%E4%BD%BF%E7%94%A8%E3%81%99%E3%82%8B]Mozilla Messaging / ナレッジベース / 複数のプロファイルを使用する[/url]
　

ここはFirefoxのフォーラムです。
Thunderbirdのものは別にあります。

今回は管理者がのちほど、移動してくれると思います。(重複投稿なさらないよう、お願いします。)
次回より、お気をつけください。

今日、初めてThunderbird を使い始めました。

すべてインポートされたようですので、
整理しようと、フォルダの「名前を変更」でクリックしたのに、
元々のフォルダ名は残って、
それとは別に新たにフォルダができました。

不要な方は消せばいいだけかと思ったのですが、
元のフォルダにも、新しいフォルダにも
中にあったメールが１つもありません。

最悪、またそれだけインポートすればいいのかとも思いますが、
どうすればいいのか分かりません。

よろしくお願いいたします :cry: