えっと・・・
理解の範囲を超えてるのですが？
「日本語ドメイン（Punycode変換済み）で登録していたIMAPのアカウントが使えなくなりました。」これは有るな
日本語ドメインをそのままにして、リンクを変える・・・普通に発生します。
べつに、怒られる事はない・・・だって日本語ドメインでは使えるんだから～

「アカウント名が空白で見えず、受信トレイが開かないどころか、
その他のアカウントのフィルター機能も同時に使えなくなってしまいます。」
不可解な部分です。
私はProfileを分けていますので普通なのですが、一般的には変ですね。

じゃ、Ver.2.0.0.Xに戻して見よう・・・これで動いたら、バグ報告・・・
(個人的には、い・や・だ！！)

なんとなく、Profileじゃないのかな～と思うのですが？

こちら、WindowsXp環境下でThunderbird 2.0.0.24から
Thunderbird3.04へアップグレードしたのですが、
日本語ドメイン（Punycode変換済み）で登録していたIMAPのアカウントが使えなくなりました。

アカウント名が空白で見えず、受信トレイが開かないどころか、
その他のアカウントのフィルター機能も同時に使えなくなってしまいます。

メールアドレスを削除して再度登録しても同じです。
（日本語ドメインのメールアドレスを削除すると、フィルター機能なども正常になりました）


どなたか解決方法をご存じないでしょうか？
よろしくお願いいたします