おかしいなと思ったらまず以下の順番で試して確認です。

(1) Thunderbird のセーフモードで起動して現象が再現するか。
　　　再現しなければアドオン（拡張機能、テーマ）が怪しいです。
(2) 新規プロファイルを作成してそれを適用して起動したら再現するか。
　　　再現しなければプロファイルに不具合がありそうです。
(3) Thunderbird のクリーンインストールで再現するか。
　　　再現しなければ Thunderbird 本体に問題がありそうです。
[color=darkred]注[/color]：お使いのプロファイルは念のためバックアップを取っておきましょう。
　
[color=darkred]補[/color]：セーフモードについては以下を参照
「トラブルシューティング - リリースノート」
http://mozilla.jp/thunderbird/2.0.0.21/releasenotes/#troubleshooting

[color=darkred]補[/color]：新規プロファイルの作成については以下を参照
「プロファイルの作成 - Thunderbird Help」
http://www.mozilla-japan.org/support/thunderbird/profile#new
　

[color=green]＊OS の種類、Thunderbird のバージョンぐらいは書き添えましょう。[/color]
　

なぜかひとつのgmail Imapアカウントが
右ウィンドウ内でダブルクリックすると
作成画面になる様になってしまいました。

Ctrl+Eの動作と同じ画面です。

設定エディタを見てみましたがチンプンカンプンで。

また、imap-gmail-2.comのフォルダだけで起こる問題と断定したのですが
中身を全て消してもなってしまいますので設定が変わってしまった？
のかと思います。

お知恵をお貸し下さい。