自己レス失礼します。

アカウントの設定で、「コピーと特別なフォルダ」にある
次のアカウントの
　「"送信済トレイ"フォルダ」
　「"下書き"フォルダ」
　「”テンプレート”フォルダ」
三つをローカルフォルダから、移動先のフォルダへ設定しなおしたら
該当フォルダの削除ができるようになりました。

以下の環境でThunderbirdを利用しています。

OS: Windows XP SP3
Mozilla Thunderbird: バージョン 2.0.0.17 (20080914)

質問は、ローカルフォルダにフォルダを作成し、しばらく使用後
別のアカウントの下にフォルダを作り直しました。
その時、古いローカルフォルダに作ったフォルダを削除しようとしましたが
右クリックしても、削除という選択肢が表示されません。

どのようにすれば、削除でますでしょうか？

ご教授の程、よろしくお願いします。