自己レスです。

結局、事象解決出来なかった為、再インストール＆作成されていたプロファイル削除した後、
フォルダを指定し直したところ、元の状態に戻せました。

実は、以前にも同様の事象に見舞われた事があり、その時は何度か行っている内に回復したのですが、今回は最後まで回復しませんでした。

メールデータの移行が上手くいかずに困っています。

現在、Thunderbird2.0.0.5を使用しているのですが、各アカウント毎のメールデータはデフォルトのprofileフォルダに保存せずに、PC上の別ドライブに専用フォルダを作成し、
ツール→アカウント設定→メッセージの保存先で別ドライブに作成したフォルダを指定し、運用していました。

ドライブの容量が減少したので、新規ドライブにメールデータを移動し、Thunderbird側でメッセージの保存先を指定し直そうとしたのですが、参照先で該当フォルダの指定までは出来るのですが、
OKボタンを押しても反応が無く （キャンセルボタン、ウインドウのXボタンは可）、当然フォルダの指定は反映されません。

念の為、フォルダ側のアクセス権限などを確認したのですが、ファイルの作成なども可能なので、書き込み権限が無いと言う訳でも無い様です。ちなみにフォルダはNTFSです。

どなたか解決策について、お知恵を貸して頂けないでしょうか？
又、メールデータの保存方法について何か問題があるのでしょうか？