[quote="Hiro"]どうやら解決できた模様です。[/quote]
これはフォルダ切り替えのダイアログが原因だったのでしょうか？
それともフィルタの条件指定による動作だったのでしょうか？

ありがとうございます！
どうやら解決できた模様です。

[quote="kiyo4_k"]他のフォルダからスペースバーや”ｎ”で読み進んでいて、フォルダを切り替えるダイアログが出た後にも 同じ現象が発生しますが、これもThunderbirdのバグだと思っています。この現象の後はプレビューペインは真っ白になり、一覧のフォーカスを見失っている状態のようでフィルタ動作後の現象と見え方は同じです。[/quote]
忘れていました。このバグを回避するには、
mailnews.nav_crosses_folders に 0 を設定すれば良いようです。
バグの引き金になるダイアログが出されなくなり、見失うことがなくなります。

[quote="kiyo4_k"]プレビューペインで選んだ瞬間に迷惑メールフォルダへ移される（バグだと思っていますが）場合もあります。ゴミ箱や迷惑メールフォルダも見てください。[/quote]
複数の条件を指定している場合や操作によって条件が変わってしまう場合にターゲットのフォルダに移されることがあるようです。迷惑メールフォルダではなくてもどこかに有るはずです、受信順に並び替えると見つかるかも。

他のフォルダからスペースバーや”ｎ”で読み進んでいて、フォルダを切り替えるダイアログが出た後にも 同じ現象が発生しますが、これもThunderbirdのバグだと思っています。この現象の後はプレビューペインは真っ白になり、一覧のフォーカスを見失っている状態のようでフィルタ動作後の現象と見え方は同じです。

[quote="Hiro"]メールはどこに行ったのでしょうか。また、どうしたらこの状態を回避できますでしょうか。
お知恵を貸してください。宜しくお願いします。[/quote]

プレビューペインで選んだ瞬間に迷惑メールフォルダへ移される（バグだと思っていますが）場合もあります。ゴミ箱や迷惑メールフォルダも見てください。

ただし、Win版での経験ですが。

MacOSX(10.4.3）で、Thunderbirdバージョン 1.5 (20051201)を、1.0.7からアップデートしました。
先ほどアップデート後、初めてメールをダウンロードしたところ、噂の自動メッセージフィルタが働き、メッセージがフォルダに仕分けられました。
[b][color=blue]ML（3）[/color][/b]のようにフォルダに表示されたので、フォルダを選択したのですが、一瞬新着メールが一覧に表示された後、行方不明になってしまいました。フォルダの表示も新着メールのない状態に戻ってしまいました。

メールはどこに行ったのでしょうか。また、どうしたらこの状態を回避できますでしょうか。
お知恵を貸してください。宜しくお願いします。