よくわからないんですけど
emlをダブルクリックすると 一度はThunderbird本体も起動しますね。メールの表示と本体と二つになります。
本体を終了させると、その後はemlをダブルクリックするとメールの表示のウィンドウだけが開いていきます。
送信用のウィンドウのみの起動は出来るのは知っていますが、メール表示ウィンドウのみ起動という機能は無いのではないでしょうか。

Thudnerbid2.0(Win)です。emlはThunderbirdに関連付けしてありました。

Thunderbird2.0を利用していますが、ファイルとして出力したemlファイルを
ダブルクリックする事でThunderbirdで開きたいです。
現在、emlファイルをダブルクリックするとThunderbirdが立ち上がるのですが、
それはThunderbird自体が2つ立ち上がり（プロセス的には1つの様子）、メール閲覧ウィンドウではありません。
ファイルとしてメールを出力する事が多々ありますので、どうにか実現できませんでしょうか？

わざわざThunderbirdを立ち上げてファイル->メッセージファイルを開く
とするのは煩わしいので、emlファイルをダブルクリックする事でメールを閲覧したいです。
出来ればOutlookExpressのようにthunderbirdのメインウィンドウは立ち上げず、
メールウィンドウのみが立ち上がってもらいたいです。（理想として）

ちなみにファイルの関連付けのパスでは、
インストールディレクトリ\thunderbird.exe -email "%1"
と記されていたので良いのかと思ったら、上記動作になるので、どうにかならないか悩んでいます。