解決策ではないのですが。

＞ヘルプを見て、プロフィールフォルダのプロパティをみたところ、閲覧専用になっていたので
＞チェックを外しましたが、同じ結果で、かつ外したにも関わらず、Firefoxをたちあげると、
＞閲覧専用に再びチェックが入るようです。

コレについては、私のところで確認してみましたが、「読み取り専用」にチェックが入っており、問題なく使用できています。


>FireFoxが3.5にあがってから

ということは、以前(3.0.*とか2.0.0.*)は問題がなかったということでよろしいでしょうか？
現在、以下の3.0.13を入れてみた場合はどうでしょうか？
問題なく使えるでしょうか？
http://mozilla.jp/firefox/locales/older/


Windows Updateをしてからとかとなると、もしかしたらOS(レジストリ)から部分的におかしくなっている可能性もあるかもしれません。
あるいは、他のブラウザーとバッティングしてしまっているとか。

最悪、OSからの入れなおしを考えておいたほうがいいかもしれません。

FireFoxが3.5にあがってからなのですが、Windows Updateをかけると、直後からFireFoxが動作しなくなります
前回は、何度かインストールしなおしているうちに治ったのですが、今回は何度インストールしても駄目でした。

具体的には、画面は立ち上がるものの
　・リンク先をクリックできない
　・右クリックで新規タブでリンクを開けるが、そのタブには移動できない
　・メニューをクリックしても、その下にあるサブメニューが表示されない

という状況です。

他のブラウザ（Sleipnir,Lunascape)では同様の状況は起きていません。


・セーフモードで試す　→　同じ結果
・プロフィールマネージャで新しいプロフィールを作って試す　→　同じ結果
・データも残さず、クリーンインストールして立ち上げる　→　同じ結果

です。

ヘルプを見て、プロフィールフォルダのプロパティをみたところ、閲覧専用になっていたので
チェックを外しましたが、同じ結果で、かつ外したにも関わらず、Firefoxをたちあげると、
閲覧専用に再びチェックが入るようです。

おなじような状況になって直したことのあるかた、他の原因に検討がつくかた、どうぞ
よろしくお願いします