EarlgreyTea さん
大変お世話になりました。
おかげさまで、何とか解決しました。

① 不具合が発生したアプリ（Nightly、Firefox Developer Edition、Firefox esr）のアンインストール機能では、まったく好転せずダメでした。

② サードパーティーのアンインストールアプリ「Bulk Crap Uninstaller」を使用して、アプリのジャンクファイルやレジストリエントリの一掃をしましたが、これまた好転せず。

③ 上記①②の実行後にも残存していた下記の「フォルダ」
Old Firefox Data
C:\Users\UserName\AppData\Local\Mozilla
C:\Users\UserName\AppData\LocalLow\Mozilla
C:\Users\UserName\AppData\Roaming\Mozilla
を一切合切削除して、
ようやく、「Settings」の全てが正常化しました。
不具合を生じていたブラウザの全てが、再起動後も至って「正常」です。

取り急ぎ、ご一報まで。

[quote="EarlgreyTea"]ちょっと書き替えたらちょうど返信入っていてびっくりしました。
まだ帰宅途中の夕食中です。
私の方はNightlyをアンインストールしてから新規に入れ直し、プロファイルは空フォルダー直指定で起動して確認しました。
なので完全に初期状態のはずです。[/quote]
私も家族揃っての夕食中だったのですが、（家族間のデジタルデトックス条項があるため）とり急いで返信させていただきました。
同様に、試行してみます。
本当にありがとうございます。

家族との約束事情により、
本日は、ここまででデジタルデトックスさせていただきます。

ちょっと書き替えたらちょうど返信入っていてびっくりしました。
まだ帰宅途中の夕食中です。
私の方はNightlyをアンインストールしてから新規に入れ直し、プロファイルは空フォルダー直指定で起動して確認しました。
なので完全に初期状態のはずです。

[quote="EarlgreyTea"]どうして Enhanced Tracking Protection がカスタムになっているのでしょうか。
何かがおかしいです。
まさかプライベートモードで起動してるとか？[/quote]
起動 path は、C:\Program Files\Firefox Nightly\firefox.exe です。
プライベートモード（C:\Program Files\Firefox Nightly\private_browsing.exe）ではありません（改めて、再確認しました）。

件の Enhanced Tracking Protection は、
Nightly、Firefox Developer Edition、Firefox esr のいずれもが常に「カスタム」が default でした。それを「Standard」に変更していました（変更可能でした）。

随分と長年、アップデート（バージョンアップ）を経てきたプログラム（Nightly、Firefox Developer Edition、Firefox esr）なので、根本的な不整合が生じているのかもしれないですね。予断ですが、ESR はエンタープライズポリシーを設定したことがあり、UI 密度のカスタマイズも実行していました。他のブラウザとの整合性を得るために「Sync」を使用して、Sync 可能な全ての項目を移行したこともありました。 [url=https://kb.mozillazine.org/Preferences_not_saved]Knowledge Base[/url] に依れば（旧来のプログラムを完全削除しての）完全なクリーンインストールが必要なのかもしれないと感じています。

どうして Enhanced Tracking Protection がカスタムになっているのでしょうか。
何かがおかしいです。
なにかオプションを付けて起動してるとか？

[quote="EarlgreyTea"]
英語表記ということなのでNightly(en-US)を新規プロファイルで起動してみました。
ということで「Send websites a "Do Not Track" request」の既定値はオフです。
リフレッシュではなく新規プロファイルにてお試しください。
あと、プログラムフォルダーに「distribution」フォルダーがあって「policies.json」ファイルが配置されていないかもご確認ください。[/quote]
ご面倒をお掛けします。
ひとまず、Firefox Nightly で「新規プロファイル」を作成し、起動してみました。

EarlgreyTea さんが提示された「画像」とは相違しています。
[attachment=0]screenshot.2023-12-18 23.53.06.png.png[/attachment]
これまで同様に「Send websites a "Do Not Track" request」はオンで、変更不可能でした。
しかも、他の「Settings」項目の状態も相違していることを認識しました。
※ブラウザ拡張機能（実装し有効化されていた Clear Browsing Data、Cookie Quick Manager、NoScript、uBlock Origin）は about:addons に存在せず、まっさらな初期状態を確認しました。
② DNS over HTTPS
Enable secure DNS using:
で任意の設定を行って「Status: Active」を確認しても
ブラウザを再起動後には、それらのすべてが回帰されてしまいます。

C:\Program Files\Firefox Nightly に「distribution」フォルダーは存在しませんでした。
念のために「WizFile」プログラムを使用して、システム内を探索しましたが、Nightly、Firefox Developer Edition、Firefox esr に関連付けられた「distribution」フォルダーと「policies.json」ファイルは存在しませんでした（蛇足ですが、唯一 LibreWolf\distribution\policies.json を確認しました）。

先ずは、ご報告まで。

[quote="諸行無常"]
ところで（そもそも）、
トピック冒頭の
about:preferences#privacy
① Website Privacy Preferences
✅ Send websites a “Do Not Track” request
をオフは可能なのでしょうか？[/quote]
英語表記ということなのでNightly(en-US)を新規プロファイルで起動してみました。[attachment=0]Website Privacy Preferences.jpg[/attachment]
ということで「Send websites a "Do Not Track" request」の既定値はオフです。
リフレッシュではなく新規プロファイルにてお試しください。
あと、プログラムフォルダーに「distribution」フォルダーがあって「policies.json」ファイルが配置されていないかもご確認ください。

[url=https://support.mozilla.org/ja/kb/refresh-firefox-reset-add-ons-and-settings]リフレッシュ[/url]した Firefox Developer Edition 121.0b9 で
公式 Firefox Help と Knowledge Base のガイドに従って、試行してみました：
● prefs.js file のプロパティは、「読み取り専用」の横のボックスにチェックは入っていなかった。
● moztmp ファイルは存在しなかった。
● prefs-n.js ファイル (n は数字) (例: prefs-2.js) は存在せず、無効な prefs.js は存在しなかった。
● 拡張機能は、ゼロです。
● 設定ファイルの破損を疑い、prefs.js ファイルを削除してみたが好転せず。
● Firefox プロファイル フォルダー内のファイルを変更から保護できるようなソフトウェア（Dell Network Assistant、McAfee Privacy Service、Norton 360 の「Firefox プライバシー クリーンアップ」機能、Advanced SystemCare with Surfing Protection など）の実装歴はありません。
● user.js ファイルも存在しませんでした。
● インストール ディレクトリ内に「mozilla.cfg」ファイルは存在しませんでした。
● Sync 機能を疑い、無効化しましたが好転しませんでした。
手段は尽くしましたが、お手上げです。

ところで（そもそも）、
トピック冒頭の
about:preferences#privacy
① Website Privacy Preferences
✅ Send websites a “Do Not Track” request
をオフは可能なのでしょうか？

本日は、ここまでで作業を打ち切ることにしました。
数日後にでも、再考してみます。

公式 Firefox Help で、
“Unable to save any preferences or settings” と検索したところ、
[url=https://support.mozilla.org/en-US/kb/how-to-fix-preferences-wont-save]How to fix preferences that won't save | Firefox Help[/url]
[url=https://kb.mozillazine.org/Preferences_not_saved]Preferences not saved - MozillaZine Knowledge Base[/url]
がヒットしました。
そのガイドに従えば「解決する」と思われます。

公式 Firefox Help と Knowledge Base に事例があり、
（デジタルデトックスのライフスタイルで iPad ユーザーの現状では）緊急性がない課題なので、
解決の糸口が見つかったので善しとすることにします（後日、おいおいと解決に励んでみることにします）。

随分と久しぶりに WindowsOS マシン（Windows_NT 10.0 19045）を使用して気付いた事なのですが、
Firefox 115.5.0esr
Firefox Developer Edition 121.0b9
Nightly 122.0a1
に共通した「不具合」を自己解決できません。
使用機材（システムとブラウザ）は「en-US」仕様なので、英語表記で記述させていただきます。

それらのブラウザ「Settings」での下記（①と②）が変更不可能に陥っています。
about:preferences#privacy
① Website Privacy Preferences
✅ Send websites a “Do Not Track” request
をオフにし、
② DNS over HTTPS
Enable secure DNS using:
で任意の設定を行って「Status: Active」を確認しても
ブラウザを再起動後には、それらのすべてがリセットされてしまいます。

② に関しては、
about:config から
network.trr.mode を「2」や「3」に手動設定し、
network.trr.uri、network.trr.bootstrapAddress などの設定を反映させても、
ブラウザの再起動後には「Status: Off」に回帰している。
network.trr.mode を再確認すると、
設定値は、常に「5」に置換されており進展を得られません。

「Registry Editor」を使用して、
ひとまず、Computer\HKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\Policies をチェックしてみましたが、
そこには Firefox に関連する項目は存在しませんでした。
ただし、Computer\HKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\Mozilla は未チェックです。

ちなみに、
[url=https://support.mozilla.org/ja/kb/refresh-firefox-reset-add-ons-and-settings]「Refresh Firefox - reset add-ons and settings」[/url]を、
Firefox Developer Edition 121.0b9 で実行しましたが状況に進展がありませんでした。

ところで、
Firefox をプラットフォームにする下記のブラウザでは「Settings」のすべてを任意に変更でき、回帰することは皆無です。
PulseBrowser 1.0.0-a.87（Firefox Release 120.0.1）：WindowsOS マシンでの常用ブラウザです。
LibreWolf 120.0.1-1（Firefox Release 120.0.1）
Floorp 11.6.1（Firefox 115.5.0esr）