まずは、下記、一つ一つ確認を。
https://support.mozilla.org/ja/kb/how-t ... -wont-save

MacOS 10.10.4　Firefox 39.0 で使用しています。

印刷の設定（アピアランス、ヘッダ、フッタ）の設定が保持されなくなってしまいました。
一度設定して印刷すると、次回の印刷は他のページの印刷でも同じ設定で印刷されたと思いますが、
アピアランスは背景をプリントなどのチェックがはずれ、ヘッダ、フッタはなしに戻ってしまいます。
39.0からなのかどうか確認はできませんが、最近出現した現象です。

セーフモードでも同様でした。

about:config の
print.print_headerleft 等の状態は「ユーザ設定」、値は空欄となっています。


皆様の環境で再現性はございますでしょうか、ご確認いただければ幸いです。