基本的にアドオンの設定は「prefs.js」(about:config)に保存されてます。
インストールされたアドオン情報の管理は「extensions.ini」「extensions.json」「extensions.log」「extensions.sqlite」で為されてた筈です。
又、Firefoxの外観に関してのファイルは「localstore.rdf」。
何れかのファイルが破損したか、パーミッションが予期せぬ動作で変更された可能性が考えられます。
以下も参考に。
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アドオンで Firefox を活用する | Firefox ヘルプ*
ブロックリストに置かれた安定性とセキュリティの問題の原因となるアドオン | Mozilla サポート