マルチポストはお控えください。
http://forum.mozilla.gr.jp/cbbs.cgi?mode=all&namber=53487&type=0&space=0&

なんだか変なことをされているようですが。

もし、3.6とBetaで同じ(ひとつの)プロファイルを使っているのでしたら、２つ（もしくはそれ以上）に分けることをお勧めします。
ひとつを3.6用、もうひとつをBeta用に。
Beta版に限らず、バージョン系列の異なるものを一つのプロファイルで使いまわすと、それだけで、不具合の原因となります。


苦言になりますが、対処できないようでしたら、(Beta版を含む)複数バージョンの併用(使用)はおやめになったほうがよろしいかと思います。

最近β版に変え、アドインを無理やり対応させていたらばくりそうになったので、3.6に戻そうとしました、がそれもかなりばぐった状態で戻ってしまうため、自分の環境の中でまだましなβ版とchromeを併用しようとしました。

「β版でツールバーの変更が保存されない」という旨のことを他掲示板で掲示させていただいたところ、対応するヘルプページを紹介してもらって、それとおりに実行しました。
http://support.mozilla.com/ja/kb/%E3%83%84%E3%83%BC%E3%83%AB%E3%83%90%E3%83%BC%E3%81%8C%E3%83%AA%E3%82%BB%E3%83%83%E3%83%88%E3%81%95%E3%82%8C%E3%81%A6%E3%81%97%E3%81%BE%E3%81%86

セーフモードで実行したところ、それは3.6のものでその後何回ブラウザを立ち上げても3.6が立ち上がります。それならそれで3.6でもいいのですが、今度は電源を再起動してまた立ち上げると、4.0になってしまいます。

他に「ツール版の変更」に関する解決法はありますか。
また、3.6と4.0のうち任意な一つを開く方法はあるのでしょうか。
お願いします。