自己レスです。あきらめてAndroid端末の従来の同期設定を削除し、新しいSyncに同期しなおしたところ、デスクトップ側のブックマークがいつの間にか復活していました。

PCがクラッシュしたためOSをリカバリーし、Firefoxを再セットアップしました。
クラッシュ前はAndroid端末とSyncで同期していたので、ここに残っているデスクトップブックマークを戻したいと思っています。
しかし、クラッシュ前後でSyncのバージョンが変更されているようで、うまく同期できません。
Android端末からはデスクトップブックマークが見えているので、これに戻したいのですが何か方法はありませんでしょうか。