こんにちは。
先日解決した事なのですが、同じ現象で困っている方もいるかと思い、情報として投稿いたします。(もっと良い情報提供先があるかもしれませんが、よくわからないので、ここに投稿します)
私は、Windows 7 Pro. で、EFS(暗号化ファイルシステム)を利用しています。EFSのデフォルトの暗号アルゴリズムはRSAだったと思いますが、これは強度が低いので、512bitのECC(楕円曲線暗号)を指定して使っています。
ところが、Firefox, Thunderbird のprofileフォルダを暗号化すると、PCを起動するたびに、prefs.jsが文字化けしてしまう、という問題に悩まされてきました。(2012/03下旬頃からです)
Firefox, Thunderbird, ウイルス対策ソフトなどをいろいろ調べましたが、どうやらEFSの問題らしい、ということまで突き止めたところで、多忙のために放置していました。
ところが、先日、
http://support.microsoft.com/kb/2739159/en-us?fr=1
というパッチを試しに当ててみたら、見事に問題が解消しました。
わざわざ楕円曲線暗号を使う人は多くないと思いますが、参考になれば幸いです。