> Sakurayaさん
早速の回答，どうもありがとうございます．
idについては，確かにその通りでしたので，これについては記載ミスでした．
という訳で，こちらはHTMLのソースを修正ですね(アンスコに置き換えかな)．

以下，蛇足です．
機能としては同等のa要素のname属性(廃止予定)の場合は，定義上はCDATA，ということで，name属性に変えてみましたが，なんと，この時はちゃんとリンクされました．
というわけで勝手にデコードしても文法的に正しいHTMLには問題ないようです．
(とは言え，勝手にデコードされるというのも，あまり気持の良い話ではないですが)．

Mozilla/5.0 (X11; Linux i686; rv:11.0a1) Gecko/20111218 Firefox/11.0a1で再現しました。
<a href="#local%20system">SomeAnchor</a>としたときは<a id="local system"/>としなければいけませんね。
ですが、[url=http://www.w3.org/TR/html4/]HTML 4.01 Specification[/url]の[url=http://www.w3.org/TR/html4/types.html#type-name]6.2 SGML basic types[/url]を読むとそもそもid属性に半角スペースと%は使えません。
使用可能な文字でidを付けていない場合はUAによって解釈が変わってもしかたがないと思います。

下記のようなanchorに対してのリンクを作成した場合の動作についての質問です．
[code]<a id="local%20system" />[/code]
同じページ中で，下記のようなリンクを作成すると，
[code]<a href="#local%20system">[/code]
Firefox8.0.1でのリンク先が下記のようになり，勝手にURIエンコード文字列がデコードされリンク先に飛べなくなってしまいます．
[code](省略)#local(半角スペース)system[/code]
anchor部にわざわざ「%20」を使用する必要があるかは兎も角として，このような動作はHTMLの解釈として正しいんでしょうか．

なお，Firefox以外については，Ｃｈｒｏｍｅ，IE，w3mで動作を確認していますが，勝手にURIエンコード文字列をデコードすることはありませんでしたので，Firefox特有の問題のようです．