[quote="えす"]ツールバーをクリックし、ページを飛ぶ[/quote]
とは、具体的にどのような操作手順を指しておられますか？

当方の環境では、ピン留めしたタブにフォーカスが当たった（つまりそのページを閲覧している）状態で、例えばナビゲーションツールバーの [ホーム] ボタンを押す（左クリックする）と、ピン留めしたタブ内に開かれるのではなく新しいタブで [ホーム] に指定してあるページが開きます。
ブックマークツールバーに登録した個別のブックマークを（左）クリックしても、新しいタブで開きます。

[quote="えす"]ブックマークの時などと違い、[/quote]
とおっしゃっていることから考えると、ピン留めしたタブにフォーカスが当たった状態で、ブックマーク（サイドバー含む）を（左）クリックしてページを開くときは、ピン留めしたタブ内にではなく新しいタブで開くということですか？

「ツールバー」とおっしゃっているのが Firefox が標準で持つツールバーではなく、アドオンとして Firefox にインストールされた「xx ツールバー」の類のことをおっしゃているのであれば、その「ツールバー」の設定や機能的な面の問題にも注意を向けてみてください。

また、タブの挙動をコントロールするアドオン（例：Tab Mix Plus など）をお使いなら、アドオンの設定等を点検してみてください。

一般に、リンクをクリックして新規タブで開きたい場合は、中ボタン・クリックがよく使われます。
【Firefox ヘルプ】
・[url=http://support.mozilla.com/ja/kb/%E3%82%BF%E3%83%96%E3%83%96%E3%83%A9%E3%82%A6%E3%82%BA#w_cechagaciuauaealciaeioaa]タブブラウズ > リンクを新しいタブに開く[/url]

Firefox の設定値が意図せず変更されているようなことがないか、点検してみるのもいいかもしれません。
（参考）
http://kb.mozillazine.org/Browser.link.open_newwindow

とりあえず以上です。外してたらすみません。

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Thunderbird 3.1.10 + others
on Windows XP Pro SP3（32bit）

ピン留めしたタブの状態でツールバーをクリックし、ページを飛ぶと、ブックマークの時などと違い、ピン留めしたタブ内で移動してしまいます。また、次回起動時も、その移動後の状態で接続されてしまうので、極若干不便なのですが、何か解決策ってありますか？
まあ、無かったら多少手間かけて、タブを開きなおしてツールバー押すだけなんですが。

Windows7SP1　Firefox4.0