Firefox以外のアプリに不都合が生じてるなら、Firefoxだけの問題では無くOS自体にトラブルを抱えてる可能性は否定出来ません。

処で何のアップロードをキャンセルしたのでしょうか？

以前はこのページに書いてあるようなメッセージが表示されてたので、
指示にしたがって再起動したのですが、うまいことまだ表示されません。

http://support.mozilla.com/ja/kb/The+bookmarks+and+history+system+will+not+be+functional?style_mode=inproduct&as=u

またmacを使ってるのですが、なぜか他のアプリケーションまで開けなくなっており、
どのようにしたらいいのかわかりません。とにかく大事なブックマークがたくさんあったので、なんとか取り戻したいです。

どなたか解決策わかる方、いらっしゃいますか？

宜しくお願いします。