1.0系からのアップグレードの場合問題あるなしにかかわらずprofileの作り直しをオススメします。
どうやら下位互換モードのような状態で動いて、順次アクセスがあった部分を1.5用に直していくような感じですから...

おっとbookmarkなどのバックアップはお忘れ無く

> きわめつけは一番下のバー(…～を読み込み中、とか表示されるバー)のさらに下に何も表示されない灰色の空間が常にあってその文ページ表示の部分が圧迫されています。

お使いのテーマや拡張機能が1.5.0.3に対応していないためだと思います。
対応を確認してください。

全て対応している場合は、プロファイルを作り直してみて下さい。
http://www.mozilla-japan.org/support/firefox/profile

ブックマークはこの中にあるbookmarks.htmlというファイルです。
古いほうから新しいほうへコピーすれば元に戻ります。

先日、Firefox1.0.Xから1.5.0.3にバージョンアップしたのですが、いろいろ不具合が出ています。
起動したあと、一度終了させると二度と起動しなかったり(ＰＣを再起動させればまた一度だけ起動できるけど)、
今までは問題なく出ていた正規のポップアップ(用語をクリックするとその説明なんかが小さいウインドウでポップアップで出る感じ)が出なくなってしまったり(そのページのブロックを解除(許可)してもダメです)、
きわめつけは一番下のバー(…～を読み込み中、とか表示されるバー)のさらに下に何も表示されない灰色の空間が常にあってその文ページ表示の部分が圧迫されています。
他の方も同様の症状が出ているのでしょうか。プラグインをいろいろ入れているのでその関係かもしれませんが。
何か解決方法はありませんでしょうか。あるいは以前のバージョンにダウングレードする方法(ブックマークやプラグインは維持したまま)はありませんでしょうか。