ありがとうございました。いろいろやってみましたが、だめでした。

[3.0.*→3.5の場合]
プロファイルフォルダのbookmarkbackupsフォルダにある当日の日付のバックアップファイルでレストア。
これで戻らなければ、方法はないと思います。


[2.0.0.*→3.5の場合]
プロファイルフォルダ内のbookmarks.htmlファイルをブラウザで表示
ここに、なくなったフォルダやブックマークがあれば、以下。
1) Firefoxを終了
2) プロファイルフォルダ内のbookmarkbackupsフォルダ、places.sqliteを移動(もしくは削除)
3) Firefoxを起動

アップグレードする当日に作成したブックマークのフォルダとその中のブックマークがなくなりました。回復の仕方はありますか。