ご指摘ありがとうございました。
「並べ替えなし」をチェックしたら直りました。
本当に初歩的な質問をしてしまって恐縮ですがとても助かりました。
もう少し自分でもよく勉強します。

[quote="luna2"]メニューバーで表示されるURLの並び順が、「ブックマークの管理」で別ウィンドウで表示されたり、表示からサイドバーに表示した場合の並び順に反映されません。
後者は一様にアイウエオ順（アルファベット順）になってしまいます。[/quote]
ブックマークの表示を名前順に変更されているのではないでしょうか。

ブックマークの管理ウィンドウを開き、メニュー＞表示のところで「[color=indigo]並べ替えなし[/color]」にチェックが入っていれば、メニュー＞ブックマークとサイドバーのブックマーク、ブックマークの管理での表示順は同じになるはずです。
同じ表示にならない場合はブックマークの管理を表示し、メニュー＞表示の「[color=indigo]並べ替えなし[/color]」にチェックを入れて、右側ペインの上部にあるタブ（デフォルトなら［名前］［URL］［説明］の３つだと思います）のどれでも良いですから、タブを3回クリックします。
もしタブのどれかが選択状態なら、そのタブには色が付いています。その場合は色の付いたタブを2回クリックします。
これで表示が同じになるはずです。

※ ブックマーク用の機能拡張を利用されている場合は、その設定画面での変更になるかもしれません。

どうしても変更が出来ない場合は、Profiles の使用しているプロファイルフォルダ内にある prefs.js をデスクトップなどに移動して再起動すれば元に戻るはずです。
が、これを行うと Firefox で行った設定をはじめ、機能拡張やテーマの設定までが初期状態になるので注意してください。

MacOSX10.4.10でFirefox2.0.0.10を使用しています。
ブックマークについてですが、メニューバーで表示されるURLの並び順が、「ブックマークの管理」で別ウィンドウで表示されたり、表示からサイドバーに表示した場合の並び順に反映されません。
後者は一様にアイウエオ順（アルファベット順）になってしまいます。
使い始めて数ヶ月しかたっていませんので、まだ不慣れなため自信がないのですが、最初の頃はちゃんと反映されていたように思います。
管理がしにくいので、メニューバーと同じ並びにしたいのですが、どのようにすればよろしいでしょうか。
アドバイスいただければ幸いです。
どうぞよろしくお願いいたします。