こんばんは、アドバイスありがとうございました。
作成したフィルタがたくさんあり、名前順に整理したり、
グループ分けできれば便利だなぁと思ったんです。

メッセージフィルタの順序を並べ替えるようなアドオンは、ちょっと思い当たりません。
[size=100]　　｜ おそらく、下記のような仕様をふまえて、
　　｜ メッセージフィルタの順序を機械的にソートするようなアドオンは
　　｜ 存在しないのではないかと思われます。[/size]

次の公式サポート記事はお読みになっておられるかと思いますが、
・[url=http://mozilla.jp/thunderbird/support/tutorials/organize#arrange-filter]Thunderbird サポート - 使い方ガイド - メッセージの整理 > メッセージを自動で振り分ける[/url]
[quote="メッセージを自動で振り分ける"]フィルタは一番上に表示された物から順に実行されます。フィルタの実行順を変更したい場合は、変更したフィルタを選択し [上に移動] [下に移動] ボタンを押して順番を変更してください。[/quote]とあります。
つまり、[ツール] -> [メッセージフィルタ] から開く [メッセージフィルタ] ウィンドウに表示されているフィルタ一覧を、各フィルタの設定内容とは無関係に名前順などで機械的に並べ替えると、フィルタの実行順序に影響を与えることになるわけです。

このあたりを承知した上でのご質問かどうかが、少し気になりました。

ご希望の回答ではないと思いますが、とりあえず以上です。外してたらすみません。

皆さんこんにちは、質問させてください。
メッセージフィルタを名前順などに整理したいのですが、
アドオンか何かを入れて、出来るのでしょうか?
宜しくお願いいたします。