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Mozilla/5.0 (Macintosh; Intel Mac OS X 10_10_3) AppleWebKit/600.6.3 (KHTML, like Gecko) Version/8.0.6 Safari/600.6.3

これ「本文が表示されなくなりました」というのは、「表示→レイアウト→メッセージペインにチェックを入れてもメッセージペインに本文が表示されない」という意味で良いでしょうか？
Mac OS X10.10（Yosemite)+Thunderbird38.0.1環境下ですが、特に問題なく表示されています。
レイアウトも「クラシック表示」「横長表示」「縦表示」と３種類やってみましたが、全て問題なく表示されています。
迷惑メールフォルダも特に読み込み不良はないように見えます。

現時点ではこれらが個々の独立した問題なのか、関連した問題なのかも判断がつきません。
Selfishさん固有の環境に依存した問題かもですが、何とも具体的に言えません。
月並みですが、
・セーフモードを試す（アドオンの干渉の有無）
https://support.mozilla.org/ja/kb/safe-mode
・新規プロファイルの作成、適用
https://support.mozilla.org/ja/kb/using ... e-profiles
あたりを試してみるとどうでしょうか。

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Thunderbirdの基本を書いています(ずっと発展途上)　とりかごとなり。
基本の操作(画像あり)：バージョン確認　/ セーフモード / 新規プロファイル作成

そうなんです、メッセージペインに本文が表示されなくなってしまいました。

結局の所、仕事で使っていてこのままだと仕事にならないので、手っ取り早くTimeMachineからThunderbirdのアプリをダウングレードしてデータを復活させて、Thunderbirdを自動的に更新させないようにして使うことにしました。

多分アドオンで最新バージョンに対応していないものが有ったので、その関係かもしれませんね・・・。
お騒がせしました。

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事情はわかりますが、異なるバージョンでプロファイル使い回すのはお勧めしません。
（「アプリをダウングレード」というあたりからTThunderbird.appのみ巻き戻しているようにみえる）
使い回しは不具合を誘発しやすいので。

それと、Thunderbirdの更新はセキュリティ問題のfixも含むので、更新止めてしまうのもお勧めできません。

見た目の問題っぽい感じがあるので、あと試すとしたら
もしテーマなど導入していたら標準のものに戻す
対応していない/動きが怪しいアドオンのみを無効化、削除する
userChrome.cssなどで見栄えを調整していたら一度外して様子見する
など。
そのほか詳しい方のアドバイスを待つとよいかもです。

「本来表示されるべきものが表示されない」ということ自体がなんらかの不具合を抱えたままである可能性が大なので、長期的にはきちんと検証して問題を解決したほうが望ましいように思います。

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