Firefox43.0.4では問題なかったのですが、本日Firefox44.0にアップデートを行ってから
flash上にマウスカーソルを置いてマウスホイールを動かしてもスクロールしなくなってしまいました。
横のスクロールバーにマウスカーソルを置き、マウスホイールを使用する分には問題なく動作します。

OSはWindows7 Professional 64bitです。

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Mozilla/5.0 (Windows NT 6.1; WOW64; rv:44.0) Gecko/20100101 Firefox/44.0

私の環境では問題なしです。

つい先日Flashが更新されましたが、バージョンは？

念のため、以下ご確認を。
https://support.mozilla.org/ja/kb/troub ... x-problems

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[Desktop] Windows 10 pro (64bit) / 16GB RAM

https://www.adobe.com/jp/software/flash/about/
にて確認を行って20.0.0.286で最新になっておりました。

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Mozilla/5.0 (Windows NT 6.1; WOW64; rv:44.0) Gecko/20100101 Firefox/44.0

再検証したら、できるサイト(Flash)、できないサイトがあるようです。
で、探したらバグ登録されていました。

https://bugzilla.mozilla.org/show_bug.cgi?id=1234958

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[Desktop] Windows 10 pro (64bit) / 16GB RAM

わざわざ御確認有り難う御座います。
とりあえず暫定的にバージョンを１つ戻しました。
早くバグフィックスしてリリース欲しいです。

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Mozilla/5.0 (Windows NT 6.1; WOW64; rv:43.0) Gecko/20100101 Firefox/43.0